蛋白降解的“死亡之吻”——泛素化
蛋白质是生命功能的主要执行者,蛋白质稳态对于细胞功能的正常发挥至关重要。在蛋白质行使功能或蛋白质的合成、折叠、转运等过程时,若蛋白质稳态失衡,便可能引发各类病变。人类细胞中存在两类主要的蛋白质降解途径,即泛素-蛋白酶体系统(ubiquitin-proteasome system,UPS)与溶酶体-自噬通路。其中,80%-90%的蛋白质降解由泛素-蛋白酶体系统介导完成。
2024年10月16日,由上海舒泽生物科技研究所主办的首届国际“泛素介导的蛋白质降解”学术论坛在上海南郊宾馆盛大开幕。

图1:首届国际“泛素介导的蛋白质降解”学术论坛上,阿龙·切哈诺沃精彩演讲
世界著名科学家、中国科学院外籍院士、2004年诺贝尔化学奖得主阿龙·切哈诺沃,全球知名免疫细胞生物学家、俄罗斯工程院外籍院士吴炯,安徽大学生命科学学院原院长、军事医学科学院博士、博士生导师张部昌,中国科学院上海生物化学研究所博士、首席科学家杨金波等160余位专家学者出席了本次论坛。论坛吸引了来自全球各地的顶尖学者、科研精英以及对该领域满怀热忱的专业人士参与。
01 国际自然“常驻”热点
当前,“泛素化”的研究热度持续攀升,2022-2023年该领域的资助经费均突破亿元。2024年中标项目数量超过240个,足见这一领域仍是当前研究的热点,也是国际自然的“常驻嘉宾”。针对这一经久不衰的研究方向,我们来探讨泛素化的本质及其临床应用。

图2:泛素化国际自然经费和项目数量统计
02 泛素化研究历史
自1975年泛素被发现以来,相关研究层出不穷。2000年,拉斯克基础医学研究奖授予Aaron Ciechanover、Avram Hershko和Alexander Varshavsky,以表彰他们在发现和阐明调节蛋白质降解的泛素系统方面的贡献。
2004年,Aaron Ciechanover、Avram Hershko和Irwin Allan Rose因发现泛素介导的蛋白质降解机制共同获得诺贝尔化学奖,掀起了泛素化研究的热潮。截至目前,“Ubiquitination”相关文章已超10万篇,其中泛素化蛋白质组学文章仅占6%。因此,在蛋白质组学蓬勃发展的当下,泛素化修饰组学仍具有广阔的研究空间与前景。

图3:2000年拉斯克基础医学奖(左),2004年诺贝尔化学奖(右)
03 泛素
泛素(Ubiquitin,Ub)是一种由76个氨基酸组成的高度保守多肽,几乎存在于真核生物的所有组织中,因广泛分布于从酵母到人类的各类细胞而得名。其分子量约为8.5kDa,在进化过程中高度保守,全长包含7个赖氨酸(Lys)位点(K6、K11、K27、K33、K48、K63)、一个位于N端的甲硫氨酸(Met)位点(M1)以及一个位于C端的甘氨酸(Gly)位点(G76)。

图4:泛素结构
04 泛素化的可逆修饰过程
泛素通过共价键结合于底物蛋白质的赖氨酸残基,被泛素标记的蛋白质会被特异性识别并迅速降解。泛素化涉及三个主要步骤:活化、结合与连接,分别由泛素激活酶(E1)、泛素结合酶(E2s)和泛素连接酶(E3s)催化完成。去泛素化则由去泛素化酶(DUB)执行,可将泛素从底物中去除,并使泛素重新循环至胞质池。

图5:泛素化和去泛素修饰形成过程
05 泛素化修饰类型
泛素结合域(UBD)可嵌入具有多种细胞功能的蛋白质中,目前已鉴别出20余种UBD,由此形成了多种泛素修饰类型。最简单的形式是靶蛋白结合单个泛素分子,称为单泛素化;靶蛋白的多个赖氨酸残基同时被单个泛素分子标记,称为多泛素化;靶蛋白的单个赖氨酸残基被多个泛素分子标记,则称为多聚泛素化。
多聚泛素化需要E1、E2和E3三种酶级联催化,而单泛素化通常仅需E1和E2催化。泛素自身也含7个赖氨酸残基(K6、K11、K27、K29、K33、K48、K63),这些残基可与另一个泛素进一步偶联,形成特异的多聚泛素链。
在所有类型的多聚泛素链中,K48和K63连接型研究最为广泛。经典的K48连接泛素化靶向底物蛋白被蛋白酶体降解,而K63连接泛素化则广泛参与信号转导与DNA损伤反应。其他六种连接类型的泛素化被称为“非典型”泛素化,不同的泛素链介导不同的生物学功能

图6:泛素不同连接类型及其功能
泛素化通过调控蛋白质的稳定性、活性、亚细胞定位及与其他蛋白质的相互作用,广泛参与免疫反应调控、DNA损伤修复、细胞周期调控、细胞增殖、凋亡和蛋白质降解等几乎所有生命活动的调控,进而参与神经退行性疾病、免疫疾病、代谢性疾病等多种疾病的发生发展过程。
蛋白质水解靶向嵌合体(PROTAC)是近年来新兴的精准医学策略,通过泛素-蛋白酶体系统(UPS)介导靶蛋白泛素化,从而实现对肿瘤生长的控制。PROTAC能够靶向降解几乎所有细胞内蛋白及跨膜蛋白,包括此前被认为“不可成药”的蛋白。

图:7:PROTAC介导的目标蛋白泛素化和蛋白酶体降解的过程

图8: 楼秀余所长为阿龙・切哈诺沃颁发聘书
当下,上海舒泽生物科技研究所,聘请在泛素领域2004年诺贝尔化学奖的阿龙·切哈诺沃为科学家顾问,并投入巨资开展PROTAC药物研究,已经取得了一系列令人瞩目的成果。
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